Le conseil d’administration de l’Université qui est l’instance de concertation et d’orientation, est présidé par le président et comprend les actionnaires, le recteur, l’inspecteur à la qualité, le directeur du centre de formation continue et de la recherche pour le développement durable, les directeur des instituts, l’agent comptable principal, le Directeur National de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique, le Maire du district de Bamako, le Directeur national de la formation professionnelle, le Président de la Chambre de Commerce et d’Industrie du Mali, le Président du Patronat du Mali, le Président de la Chambre des Mines, le président de l’APCAM, le Président de la chambre des métiers, le représentant des professeurs, représentant des étudiants. Il se réunit au moins une fois par an et peut être convoqué aussi souvent que de besoin sur convocation du Président de l’université.